С 2025 года налоговое законодательство РФ кардинально изменило подход к взаимодействию упрощенной системы налогообложения (УСН) и налога на добавленную стоимость (НДС). Если ранее упрощенцы были практически полностью освобождены от НДС (за исключением отдельных случаев, например, импорт товаров), то теперь значительная часть плательщиков УСН с объектом «Доходы минус расходы» становится полноценными плательщиками НДС с правом на вычет и возмещение.

В данной статье подробно разбираем, как работает механизм возмещения НДС для организаций и ИП на УСН «Доходы минус расходы», какие условия необходимо соблюсти, как формируется налоговая база и как правильно учитывать входящий НДС в расходах, если вычет недоступен.

Кто обязан платить НДС на УСН с 2025–2026 годов?

Согласно изменениям в Налоговом кодексе РФ (ст. 346.12, 174.1 НК РФ), обязанность уплачивать НДС возникает у плательщиков УСН при превышении порогового значения доходов.

• С 2025 года: Обязанность возникает, если доходы за 2024 год превысили 60 млн руб.
• С 2026 года: Порог снижается до 45 млн руб. (доходы за 2025 год).
• Дальнейшие снижения: Законом предусмотрено поэтапное снижение лимита до 25 млн руб. в последующие годы.

Важно: Плательщики УСН могут зарегистрироваться по НДС добровольно (п. 2 ст. 174.1 НК РФ), даже если доходы ниже порога. Это выгодно, если основные контрагенты, плательщики НДС 20%, и есть необходимость принимать входящий НДС к вычету.

Особенности расчета НДС к уплате (Исходящий НДС)

Главное отличие расчета НДС на УСН от общеной системы (ОСНО), порядок определения налоговой базы.

Налоговая база по НДС для упрощенца = Доходы без НДС (Валовый доход)

Согласно п. 4 ст. 174.1 НК РФ и разъяснениям ФНС (методичка 2025 г.), налоговую базу по НДС упрощенцы определяют не уменьшая доходы на сумму расходов.

Пример: Организация на УСН «Доходы минус расходы» получила выручку 31 млн руб. (в т.ч. НДС). Расходы составили 26 млн руб.

Для целей УСН база = 5 млн руб. (31 ー 26).

Для целей НДС база = 31 млн руб. (доходы без уменьшения на расходы); НДС к уплате рассчитывается именно от 31 млн руб.

Ставки НДС стандартные: 20% (базовая) и 10% (уменьшенная, для реализации социально значимых товаров). С 2025 года упрощенцы не могут применять ставку 5% (она отменена для УСН, осталась только для автосамозанятых).

Входящий НДС: Вычет или Расход?

Это ключевой момент для объекта «Доходы минус расходы». Налоговый кодекс (ст. 346.16, 174.1 НК РФ) устанавливает жесткую альтернативу:

1. Есть право на вычет -> НДС принимается к вычету (уменьшает НДС к уплате в декларации). В расходы по УСН он НЕ включается.
2. Нет права на вычет -> НДС включается в состав расходов по УСН (уменьшает базу УСН). В декларации по НДС он НЕ вычитается.

Условия принятия НДС к вычету (п. 3 ст. 174.1 НК РФ)

Упрощенец имеет право на вычет входящего НДС, если одновременно соблюдены условия:

• Товары (работы, услуги) приобретены для деятельности, облагаемой НДС (не для освобожденной).
• Есть надлежаще оформленные счета-фактуры (ЭСФ/ИСФ) или иные документы (ГТД, квитанции таможни).
• Поставщик — плательщик НДС, который передал сведения в ФНС (для ЭСФ).
• НДС выделен в счете-фактуре отдельно.

Включение НДС в расходы при УСН (п. 1.1 ст. 346.16 НК РФ)

Если право на вычет отсутствует (например, поставщик на УСН/Патенте не выделял НДС, или это закупка для освобожденной от НДС деятельности, или утерян счет-фактура), сумма входящего НДС включается в налоговые расходы в том налоговом (отчетном) периоде, в котором получены документы, подтверждающие расходы (счет-фактура, УПД, чек ККТ с указанием НДС).

Нюанс 2026 года: Ранее (до 2025 г.) упрощенцы всегда включали НДС в расходы. Теперь это право остается только там, где нет права на вычет. Дважды учитывать НДС (и в вычете, и в расходах) запрещено.

Механизм возмещения НДС: Как получить деньги с бюджета?

Возмещение — это возврат из бюджета излишне уплаченных сумм НДС (когда сумма вычетов превышает сумму налога к уплате). Для упрощенцев процедура имеет свою специфику.

Главное правило: «Сначала заплати — потом проси назад»

Согласно ст. 176 НК РФ и разъяснениям ФНС, возмещение возможно только после того, как НДС к уплате был фактически перечислен в бюджет (списан с ЕНС/единого налогового счета). Нельзя получить возмещение «на бумаге», имея задолженность по НДС.

Порядок действий (Алгоритм)

1. Расчет НДС к уплате: В декларации по НДС (сдается ежеквартально) рассчитываем налог к уплате от валовой выручки.
2. Принятие вычетов: В той же декларации (в разделе «Вычеты») принимаем входящий НДС по закупкам (при соблюдении условий п. 3 ст. 174.1 НК РФ).
3. Сравнение: Если Сумма вычетов > НДС к уплате -> образуется сумма к возмещению (стр. 180 декларации).
4. Оплата в бюджет: Необходимо уплатить НДС к уплате (стр. 170 декларации) не позднее 25-го числа месяца, следующего за отчетным кварталом. Без этого шага возмещение не запустится.
5. Подача заявления: После сдачи декларации и оплаты налога подается Заявление на возмещение (форма уст. Приказом ФНС от № ЕД-7-8/937@).
6. Камеральная проверка: ФНС проводит проверку в течение 3 месяцев (может быть продлена).
7. Перечисление: Деньги приходят на счет в течение 10 дней после решения о возмещении.

Формула расчета суммы к возмещению

Сумма к возмещению = (Сумма принятых к вычету входящих НДС) — (НДС к уплате по реализациям за квартал)

Пример расчета за квартал:

• Выручка (без НДС): 10 000 000 руб. -> НДС к уплате (20%): 2 000 000 руб.
• Закупки у плательщиков НДС 20%: 6 000 000 руб. (без НДС) -> Входящий НДС: 1 200 000 руб.
• Закупки у плательщиков НДС 10%: 2 000 000 руб. (без НДС) -> Входящий НДС: 200 000 руб.

Результат: НДС к уплате (2 000 000) > Вычетов (1 400 000). Возмещения нет. Доплачиваем 600 000 руб.

Ситуация с возмещением (экспорт/нулевая ставка):

• Выручка: Экспорт 10 000 000 руб. (ставка 0%) -> НДС к уплате: 0 руб.
• Закупки (вх. НДС): 1 400 000 руб.

Результат: Вычеты (1 400 000) > Налог к уплате (0). Сумма к возмещению = 1 400 000 руб.

Примечание: При реализации по ставке 0% (экспорт) упрощенцы сохраняют право на вычет и возмещение (п; 5 ст. 174.1 НК РФ).

Переходные правила: НДС по остаткам на

Особый порядок установлен для входящего НДС, который был включен в стоимость остатков товаров/материалов на 1 января 2025 года и не был принят к вычету ранее (п. 12 ст. 2 ФЗ-389).

• Такой НДС можно принять к вычету в 2025 году (и последующих) пропорционально списанию этих товаров в расходы/реализации.
• Условие: по этим товарам должен быть сохранен первичный документ (счет-фактура от поставщика-плательщика НДС).
• Если вычет не принят (нет документов или товары списаны на освобожденную деятельность) — НДС включается в расходы УСН при списании товаров.

Специфические ситуации и риски

Смешанная деятельность (Облагаемая + Освобожденная от НДС)

Если упрощенец совмещает продажи с НДС (20%/10%/0%) и освобожденные от НДС (ст. 149 НК РФ, ст. 174.1 НК РФ), входящий НДС распределяется пропорционально доходам (п. 4 ст. 174.1 НК РФ).

• Часть НДС, приходящаяся на облагаемую деятельность -> Вычет.
• Часть НДС, приходящаяся на освобожденную деятельность -> Расходы УСН (вычет запрещен).

Контур.Экстерн предупреждает: Нельзя учитывать в расходах УСН весь входящий НДС, если есть освобожденная деятельность. Только ту долю, что относится к ней.

Работа через агентов (Комиссионеры, Маркетплейсы)

При получении отчета от агента (маркетплейса) доход для УСН учитывается чистый (без удержанного агентом НДС).

Пример: Агент перевел 950 000 руб. (удержал 50 000 руб. НДС). Доход по УСН = 950 000 руб. НДС агента (50 000) не облагается УСН. По НДС: база = 1 000 000 руб. (полная сумма), НДС к уплате = 200 000 руб. (при ставке 20%). Агент уже передал 50 000 руб. -> Упрощенец доплачивает 150 000 руб.

Взаимозависимые контрагенты

Судебная практика (КонсультантПлюс) указывает: если контрагент-упрощенец не имеет права на вычет НДС (например, не зарегистрирован по НДС добровольно и доходы ниже порога), но фактически получил счет-фактуру с НДС, он не может вычесть его, но включает в расходы УСН. Однако схемы «раздробления» бизнеса для получения вычетов контролируются ФНС.

Практический чек-лист для бухгалтера/ИП на 2026 год

1. Проверьте порог доходов за 2025 г. (> 45 млн руб. -> обязательная регистрация по НДС с 2026 г.).
2. Настройте учетную политику: Зафиксируйте порядок разделения НДС на вычет/расходы при смешанной деятельности.
3. Проверяйте контрагентов: Работайте только с плательщиками НДС, которые сдают отчетность (проверяйте статус на сайте ФНС перед оплатой).
4. Контролируйте ЭСФ: Принимайте к вычету только те счета-фактуры, которые прошли проверку в ЭДО/ЛК ФНС (статус «Пройден контроль»).
5. Планируйте платежи: Готовьте средства на уплату НДС к 25-му числу (квартал). Без оплаты возмещение не получите.
6. Сдавайте декларацию по НДС вовремя: До 25-го числа месяца за квартал. Просрочка = штрафы и блокировка возмещения.
7. Учитывайте остатки : Не упустите право вычесть «старый» НДС при реализации старых партий.

Резюме: Главные отличия УСН «Доходы-Расходы» от ОСНО по НДС

Переход на обязательную уплату НДС для упрощенцев с объектом «Доходы минус расходы» — это не только дополнительная налоговая нагрузка (НДС считается с валовой выручки), но и возможность легально снизить налог на прибыль/УСН за счет вычетов и получать возмещение из бюджета (например, при экспорте или накоплении вычетов).

Ключ к успеху в 2026 году — грамотное разделение потоков: четкое понимание, где НДС идет в вычет (уменьшает НДС к уплате и дает возмещение), а где — в расходы по УСН (уменьшает базу УСН 15%). Ошибки в этом разделе приводят либо к переплате УСН (если включили в расходы то, что можно было вычесть), либо к налоговым рискам (если вычли то, что следовало заложить в расходы).

Рекомендуется использовать современные сервисы ЭДО и программы учета (1С, Контур, МойСклад), поддерживающие автоматическое разделение НДС по правилам ст. 174.1 НК РФ, и регулярно мониторить обновления методички ФНС по НДС для УСН.

Статья подготовлена на основе нормативных актов (НК РФ, ФЗ-389 от ), методички ФНС России 2025 года и судебной практики на 2025–2026 гг. Информация носит ознакомительный характер. Для принятия решений по конкретным ситуациям обратитесь к профессиональному налоговому консультанту.